MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Actinoplanes sp. SE50/110 chromosome

Total Repeats: 240233

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017803	GCC	2	6	207971	207976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845250
5002	NC_017803	TGC	2	6	207988	207993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845250
5003	NC_017803	GTG	2	6	208044	208049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845250
5004	NC_017803	TGC	2	6	208104	208109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845250
5005	NC_017803	GGCC	2	8	208201	208208	0 %	0 %	50 %	50 %	386845250
5006	NC_017803	TGG	2	6	208248	208253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845250
5007	NC_017803	GGC	2	6	208298	208303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845250
5008	NC_017803	CG	3	6	208329	208334	0 %	0 %	50 %	50 %	386845250
5009	NC_017803	CGGGG	2	10	208352	208361	0 %	0 %	80 %	20 %	386845250
5010	NC_017803	TGGTC	2	10	208507	208516	0 %	40 %	40 %	20 %	386845250
5011	NC_017803	CGG	2	6	208587	208592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845250
5012	NC_017803	GAT	3	9	208601	208609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845250
5013	NC_017803	CGT	2	6	208699	208704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845250
5014	NC_017803	GGTGCC	2	12	208730	208741	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386845250
5015	NC_017803	CGA	3	9	208756	208764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845250
5016	NC_017803	CGGT	2	8	208785	208792	0 %	25 %	50 %	25 %	386845250
5017	NC_017803	GTC	2	6	208854	208859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845250
5018	NC_017803	TGG	2	6	208914	208919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845250
5019	NC_017803	CGC	2	6	208990	208995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845250
5020	NC_017803	CGG	2	6	208999	209004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845250
5021	NC_017803	AGGC	2	8	209031	209038	25 %	0 %	50 %	25 %	386845250
5022	NC_017803	CGC	2	6	209040	209045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845250
5023	NC_017803	GTC	2	6	209048	209053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845250
5024	NC_017803	AGA	2	6	209115	209120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845250
5025	NC_017803	ACC	2	6	209244	209249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845250
5026	NC_017803	GCA	2	6	209260	209265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845250
5027	NC_017803	ACGTCG	2	12	209307	209318	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386845250
5028	NC_017803	CTCA	2	8	209470	209477	25 %	25 %	0 %	50 %	386845251
5029	NC_017803	GTC	2	6	209494	209499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845251
5030	NC_017803	GCG	2	6	209545	209550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845251
5031	NC_017803	CGG	2	6	209624	209629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845251
5032	NC_017803	GGCGGT	2	12	209667	209678	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386845251
5033	NC_017803	CGG	2	6	209681	209686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845251
5034	NC_017803	TGC	2	6	209690	209695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845251
5035	NC_017803	GCG	2	6	209728	209733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845251
5036	NC_017803	GGT	2	6	209904	209909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845252
5037	NC_017803	GCC	3	9	209954	209962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845252
5038	NC_017803	CGG	2	6	209983	209988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845252
5039	NC_017803	CGG	2	6	210004	210009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845252
5040	NC_017803	CGG	2	6	210032	210037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845252
5041	NC_017803	TGG	2	6	210052	210057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845252
5042	NC_017803	GTC	2	6	210084	210089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845252
5043	NC_017803	TCG	2	6	210102	210107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845252
5044	NC_017803	CCG	2	6	210153	210158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845252
5045	NC_017803	GC	3	6	210247	210252	0 %	0 %	50 %	50 %	386845252
5046	NC_017803	TGG	2	6	210253	210258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845252
5047	NC_017803	CCG	2	6	210324	210329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845252
5048	NC_017803	CGC	3	9	210478	210486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845252
5049	NC_017803	TCG	2	6	210526	210531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845252
5050	NC_017803	CGGC	2	8	210541	210548	0 %	0 %	50 %	50 %	386845252
5051	NC_017803	CAC	2	6	210590	210595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845252
5052	NC_017803	TGC	2	6	210609	210614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845252
5053	NC_017803	CCGG	2	8	210711	210718	0 %	0 %	50 %	50 %	386845252
5054	NC_017803	GGC	2	6	210719	210724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845252
5055	NC_017803	CGA	2	6	210742	210747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845252
5056	NC_017803	CAC	2	6	210767	210772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845252
5057	NC_017803	AG	3	6	210834	210839	50 %	0 %	50 %	0 %	386845252
5058	NC_017803	GTC	3	9	210848	210856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845252
5059	NC_017803	GGA	2	6	210878	210883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845252
5060	NC_017803	GGC	2	6	210888	210893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845252
5061	NC_017803	CGG	2	6	210913	210918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845252
5062	NC_017803	GCC	2	6	210962	210967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845252
5063	NC_017803	GGT	2	6	210979	210984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845252
5064	NC_017803	CGGC	2	8	210991	210998	0 %	0 %	50 %	50 %	386845252
5065	NC_017803	GGC	2	6	211025	211030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845252
5066	NC_017803	GGT	2	6	211102	211107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845252
5067	NC_017803	CCG	2	6	211113	211118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845252
5068	NC_017803	CGT	2	6	211157	211162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845252
5069	NC_017803	CTTGTC	2	12	211205	211216	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386845252
5070	NC_017803	ACG	2	6	211218	211223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845252
5071	NC_017803	ACC	2	6	211387	211392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845252
5072	NC_017803	CGT	2	6	211396	211401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845252
5073	NC_017803	CGC	2	6	211417	211422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845252
5074	NC_017803	GCAT	2	8	211443	211450	25 %	25 %	25 %	25 %	386845252
5075	NC_017803	GTTT	2	8	211553	211560	0 %	75 %	25 %	0 %	386845252
5076	NC_017803	CAC	2	6	211616	211621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845252
5077	NC_017803	CGC	2	6	211642	211647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845252
5078	NC_017803	CGGG	2	8	211683	211690	0 %	0 %	75 %	25 %	386845252
5079	NC_017803	CGA	2	6	211735	211740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845252
5080	NC_017803	CGG	2	6	211804	211809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845252
5081	NC_017803	CGA	2	6	211811	211816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845252
5082	NC_017803	CG	3	6	211827	211832	0 %	0 %	50 %	50 %	386845252
5083	NC_017803	ATC	2	6	211871	211876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845252
5084	NC_017803	GCCG	2	8	211895	211902	0 %	0 %	50 %	50 %	386845252
5085	NC_017803	TCG	2	6	213247	213252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845253
5086	NC_017803	TCG	2	6	213334	213339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845253
5087	NC_017803	GCG	4	12	213376	213387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845253
5088	NC_017803	AGC	2	6	213445	213450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845253
5089	NC_017803	CGA	2	6	213470	213475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845253
5090	NC_017803	GC	3	6	213518	213523	0 %	0 %	50 %	50 %	386845253
5091	NC_017803	CCGCGA	2	12	213533	213544	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386845253
5092	NC_017803	CAG	3	9	213573	213581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845253
5093	NC_017803	GTG	2	6	213931	213936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845254
5094	NC_017803	AGT	2	6	213942	213947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845254
5095	NC_017803	GGT	2	6	213963	213968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845254
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5098	NC_017803	CGG	3	9	214084	214092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845254
5099	NC_017803	GAT	2	6	214157	214162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845254
5100	NC_017803	CTT	2	6	214204	214209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386845254
5101	NC_017803	CGA	2	6	214210	214215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845254
5102	NC_017803	GGC	2	6	214221	214226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845254
5103	NC_017803	GGC	2	6	214231	214236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845254
5104	NC_017803	GGTGGG	2	12	214256	214267	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	386845254
5105	NC_017803	GAC	2	6	214277	214282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845254
5106	NC_017803	CGG	2	6	214318	214323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845254
5107	NC_017803	CGG	2	6	214369	214374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845254
5108	NC_017803	TGA	2	6	214375	214380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845254
5109	NC_017803	CGC	2	6	214384	214389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845254
5110	NC_017803	CGG	2	6	214405	214410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845254
5111	NC_017803	CGGCG	2	10	214447	214456	0 %	0 %	60 %	40 %	386845254
5112	NC_017803	GGCCAG	2	12	214472	214483	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386845254
5113	NC_017803	GCC	2	6	214508	214513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845254
5114	NC_017803	CCG	2	6	214590	214595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845254
5115	NC_017803	CGT	2	6	214597	214602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845254
5116	NC_017803	CGC	2	6	214618	214623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845254
5117	NC_017803	TGA	2	6	214624	214629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845254
5118	NC_017803	CGG	2	6	214704	214709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845254
5119	NC_017803	ACC	2	6	214749	214754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845254
5120	NC_017803	CAG	2	6	214763	214768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845254
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5123	NC_017803	CGA	2	6	214831	214836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845254
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5239	NC_017803	CGG	2	6	219280	219285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845258
5240	NC_017803	CGG	2	6	219289	219294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845258
5241	NC_017803	GCC	2	6	219330	219335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845258
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5341	NC_017803	GACTCC	2	12	226546	226557	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386845267
5342	NC_017803	CCGGG	2	10	226613	226622	0 %	0 %	60 %	40 %	386845267
5343	NC_017803	CCA	2	6	226634	226639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845267
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5346	NC_017803	GTAC	2	8	226844	226851	25 %	25 %	25 %	25 %	386845267
5347	NC_017803	CGG	2	6	226907	226912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845267
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5352	NC_017803	GCA	2	6	227090	227095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845267
5353	NC_017803	GAC	2	6	227112	227117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845267
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5355	NC_017803	CAT	2	6	227168	227173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845267
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5357	NC_017803	GTGCG	2	10	227194	227203	0 %	20 %	60 %	20 %	386845267
5358	NC_017803	GCG	2	6	227209	227214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845267
5359	NC_017803	AGC	2	6	227221	227226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845267
5360	NC_017803	GCC	2	6	227239	227244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845267
5361	NC_017803	GTC	2	6	227310	227315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845267
5362	NC_017803	CGG	2	6	227336	227341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845267
5363	NC_017803	TTG	2	6	227347	227352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386845267
5364	NC_017803	CAC	2	6	227370	227375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845267
5365	NC_017803	GCG	2	6	227410	227415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845267
5366	NC_017803	GCA	2	6	227435	227440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845267
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5372	NC_017803	CAC	2	6	227657	227662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845267
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5380	NC_017803	TTG	2	6	228857	228862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386845268
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5460	NC_017803	CAC	2	6	233245	233250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845273
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